Po zakończeniu kariery w 1994, Verbeek został w SC Heerenveen w roli asystenta trenera. W 2001 odszedł, by poprowadzić Heracles Almelo, później zastąpił Foppe de Haana w SC Heerenveen. W 2008 przez krótki okres pracował w Feyenoordzie, z którego został zwolniony z powodu konfliktów z zawodnikami[1]. W sezonie 2009–2010 wrócił do Heraclesa, z którym zajął 6 miejsce w Eredivisie. W kolejnym sezonie zatrudniony został w AZ Alkmaar. Po incydencie w trakcie meczu z serii rozgrywek o Puchar Holandii w grudniu 2011 pomiędzy Ajaksem i AZ Alkmaar, gdy kibic, który wtargnął na murawę Amsterdam ArenA, został powalony kopnięciem przez Estebana Alvarado, ukaranego za to zachowanie czerwoną kartkę[2] wydał zawodnikom polecenie opuszczenia boiska. Mecz został przerwany.