Swoją karierę piłkarską Hanousek rozpoczął w klubie Slavia Praga. Następnie rozpoczął treningi w juniorach Dukli Praga. W 2012 roku awansował do kadry pierwszej drużyny i 26 maja 2013 zadebiutował w niej w pierwszej lidze czeskiej w wygranym 2:1 domowym meczu z FK Mladá Boleslav. W Dukli grał do lata 2015 roku.
Latem 2015 roku Hanousek przeszedł do FK Jablonec. Swój debiut w Jabloncu zanotował 25 września 2015 w przegranym 1:2 domowym meczu z FK Mladá Boleslav.